با توجه به تاکیدات مقام معظم رهبری، هیأت دولت و مجلس شورای اسلامی بر متمرکز نمودن فعالیت های رشد و توسعه اقتصادی به سمت عدالت اجتماعی و کاهش فاصله میان درآمدهای طبقات و رفع محرومیت از قشر کم درآمد، اهتمام دانشگاه ها و مراکز آموزش عالی به امر تحقیق و پژوهش، توجه به معیشت روستائیان با توجه به شرایط ویژه منطقه سیستان از نظر همجواری با کشورهای افغانستان و پاکستان، شرایط اقتصادی و تولیدی منطقه، دانشگاه زابل بنابر رسالت الهی خویش و وجود بستر مناسب و منحصر بفرد و با توجه به موافقت اولیه ریاست محترم جمهوری در سفر استانی سال ۸۴ به استان سیستان و بلوچستان درخصوص ایجاد و راه اندازی پژوهشکده های جدید و نیز موافقت قطعی شورای محترم گسترش آموزش عالی با تأسیس پژوهشکده تحقیقات دام های خاص در مورخ ۱۳۸۵/۱۰/۰۴، این پژوهشکده با سه گروه پژوهشی ذیل تاسیس گردید:
اساتید
طرح های پژوهشی
فعالیت های پژوهشی
پژوهشکده دام های خاص