پژوهشگاه زابل با هدف توسعه پژوهش‌های کشاورزی، دامپروری، منابع طبیعی و محیط زیست، حفظ گونه‌های گیاهی و دامی و ایجاد بانک ژن دام‌های بومی به دنبال توانمندسازی منطقه، اشتغال پایدار و تبادل دانش در سطح منطقه ای و ملی است. این پژوهشگاه طرح‌های کاربردی مختلفی را برای تغییر الگوی کشت، احیای تالاب‌ها و جلوگیری از تبخیر و فرسایش اجرا می‌کند.